Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4AP27815 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms