Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRZ1P23471 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRZ1P23471 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms