Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RPS6KB1P23443 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms