Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NF1P21359 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NF1P21359 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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NF1P21359 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NF1P21359 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NF1P21359 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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