Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCNA2P20248 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCNA2P20248 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms