Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA6P17066 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA6P17066 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HSPA6P17066 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA6P17066 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms