Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NR2F1P10589 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NR2F1P10589 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms