Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCL3P10147 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3P10147 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3P10147 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3P10147 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3P10147 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCL3P10147 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCL3P10147 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms