Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IGHV1-8P0DP01 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IGHV1-8P0DP01 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms