Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD3P0DMS9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms