Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RGPD2P0DJD1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RGPD2P0DJD1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms