Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC172P0C7W6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC172P0C7W6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms