Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PARP1P09874 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PARP1P09874 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP1P09874 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PARP1P09874 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PARP1P09874 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PARP1P09874 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms