Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB5P09067 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms