Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MBD3O95983 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD3O95983 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD3O95983 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MBD3O95983 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MBD3O95983 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms