Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHOBTB3O94955 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RHOBTB3O94955 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms