Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VAMP4O75379 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VAMP4O75379 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms