Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPFIA3O75145 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PPFIA3O75145 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms