Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CTNSO60931 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CTNSO60931 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTNSO60931 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms