Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRD4O60885 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRD4O60885 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRD4O60885 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
BRD4O60885 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRD4O60885 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRD4O60885 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms