Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATP10AO60312 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP10AO60312 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms