Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
KIAA0556O60303 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
KIAA0556O60303 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms