Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAK2O60296 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms