Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZBTB39O15060 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ZBTB39O15060 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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