Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHOX2AO14813 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PHOX2AO14813 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms