Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms