Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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