Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms