Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
E9PBE3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
E9PBE3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
E9PBE3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms