Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms