Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PCNX2A6NKB5 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms