Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC160A6NGH7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC160A6NGH7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms