Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00862A6NCI5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms