Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL33A6NCF5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL33A6NCF5 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms