Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB19A4D1S5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms