Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
IRGMA1A4Y4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms