Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G8

TRBV10-2, T-cell receptor beta variable 10-2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV10-2A0A0K0K1G8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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