Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 CCR6-202ENST00000349984 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MTHFD1P1-201ENST00000413059 2764 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 IFT80-225ENST00000496589 3073 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC083864.2-201ENST00000446024 482 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 HNRNPCP8-201ENST00000528764 888 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 DYNLRB2-204ENST00000562982 492 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 GTF2E1-201ENST00000283875 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 NPIPB9-202ENST00000550983 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 C4orf26-201ENST00000311623 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
NFKB1P19838 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms