Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 FREM2-201ENST00000280481 16070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 INHBA-AS1-203ENST00000422822 2312 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
CACNA1SQ13698 AL589740.1-201ENST00000457513 756 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.44
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