Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
CHAF1AQ13111 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
CHAF1AQ13111 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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