Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LINC02218-202ENST00000504998 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
BPTFQ12830 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MYO6-201ENST00000369975 5387 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MIGA1-202ENST00000443751 6409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
BPTFQ12830 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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