Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 RPE-213ENST00000445268 668 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PRKAG2-AS1-201ENST00000464464 382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPARP-AS1-203ENST00000494270 711 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL124P-201ENST00000498656 285 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AP001372.1-202ENST00000533008 344 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 WTAPP1-203ENST00000537774 400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC007406.2-201ENST00000540868 503 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC008474.1-201ENST00000589127 573 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC01347-202ENST00000627498 3841 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL139039.3-201ENST00000413129 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SLC30A8-201ENST00000427715 5430 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DMBT1-203ENST00000344338 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DMBT1-205ENST00000368955 7656 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ITIH2-202ENST00000379587 2848 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC012409.5-201ENST00000624746 3424 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RAB36-201ENST00000263116 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNF14-205ENST00000394520 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LINC01012-204ENST00000629732 2771 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SCRN1-206ENST00000426154 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ITGB6-201ENST00000283249 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 BHLHB9-205ENST00000457056 4082 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RUNX1T1-250ENST00000614812 7483 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL031229.1-201ENST00000404273 224 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC015977.2-201ENST00000420852 567 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL161447.1-201ENST00000427811 230 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RALY-AS1-202ENST00000432859 610 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL049733.1-201ENST00000440178 603 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 C3orf67-AS1-201ENST00000463703 562 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RN7SL144P-201ENST00000475761 295 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MPTX1-201ENST00000480235 609 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC010307.2-202ENST00000502776 570 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MTND6P17-201ENST00000511811 519 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC022296.1-201ENST00000512176 682 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CCND2P1-201ENST00000539268 799 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MIR3918-201ENST00000581555 93 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ARMCX7P-202ENST00000602449 655 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 Metazoa_SRP.101-201ENST00000611704 303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ABBA01040607.1-201ENST00000640749 321 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 PPP4R1L-202ENST00000334187 2746 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TARS-202ENST00000455217 2523 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 BPNT1-201ENST00000322067 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 CLCC1-206ENST00000369970 2078 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AKAP2-202ENST00000374525 6866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 HSP90AB1-201ENST00000353801 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SPIN3-211ENST00000638712 4286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 RNF185-202ENST00000326132 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 AC079466.1-201ENST00000587961 4453 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 TNFSF11-204ENST00000405262 2135 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EFHC1-226ENST00000636954 2129 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 FASTKD2-202ENST00000402774 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 MYT1L-202ENST00000399161 7063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
CACNB1Q02641 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms