Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
PTPRMP28827 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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