Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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RTL8BQ17RB0 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RTL8BQ17RB0 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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