Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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FOXF2Q12947 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
FOXF2Q12947 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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