Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
CASQ1P31415 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms