Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 ENTPD5-207ENST00000557325 3096 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RAPGEF4-214ENST00000538974 3920 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 RNF217-AS1-201ENST00000439075 4507 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
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GRIK4Q16099 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
GRIK4Q16099 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
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