Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC021483.1-201ENST00000560760 539 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
BRD3Q15059 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 PSMD10P2-201ENST00000432890 672 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC015574.1-202ENST00000616588 456 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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