Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SNX16-202ENST00000353788 3032 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PYHIN1-202ENST00000368138 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL365204.1-201ENST00000423440 1430 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK2A3-201ENST00000528848 1416 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DCSTAMP-208ENST00000622554 1471 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ASNSP6-201ENST00000592770 1618 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP378-201ENST00000363646 120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 WDR89-202ENST00000394942 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZEB1-AS1-202ENST00000424191 320 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL157414.2-201ENST00000442780 377 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL338P-201ENST00000481467 293 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC064805.1-203ENST00000577560 526 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC008770.1-209ENST00000591898 356 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC005884.2-201ENST00000593107 247 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF675-202ENST00000596211 581 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC012557.3-201ENST00000626439 255 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TTN-AS1-265ENST00000627661 806 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MS4A6A-208ENST00000528851 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01105-204ENST00000444416 2695 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA1-211ENST00000635880 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf54-203ENST00000369102 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FHL1-203ENST00000370676 833 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SSX9-201ENST00000376909 591 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
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