Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CLDN10-201ENST00000299339 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC026310.1-201ENST00000396004 378 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 IGBP1-AS2-201ENST00000403371 513 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 RPSAP40-201ENST00000442343 891 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 BX323845.2-201ENST00000458382 234 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 PRR13P5-201ENST00000596581 442 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ZMYND11-204ENST00000381604 4066 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 PSG2-202ENST00000406487 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 ZFY-207ENST00000625061 2273 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 TPTE2P2-201ENST00000403471 1466 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 SLC14A1-208ENST00000586142 2846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 USPL1-203ENST00000614860 4074 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MTMR3Q13615 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms